El DBBE se formó a partir de la reorganización del anterior Departamento de Ciencias Biológicas en el año 2001 y actualmente es uno de los departamentos que conforman la Carrera de Biología. Si bien el anterior Departamento de Biología se reorganizó en los tres actuales (DBBE, DEGE y DFBMC), la Licenciatura en Ciencias Biológicas es única al igual que la Carrera del Doctorado. La Comisión de Carrera de Ciencias Biológicas (CCCB) es la encargada de centralizar todos aquellos trámites relacionados con los/las estudiantes.

En esta dependencia coexisten cerca de 30 grupos de investigación, algunos de los cuales desarrollan sus tareas dentro del Departamento y en institutos vinculados.

La docencia es parte fundamental de las actividades desarrolladas en el DBBE, dictando actualmente 31 materias de grado de la Carrera por año (17 durante el primer cuatrimestre y 14 durante el segundo cuatrimestre). También se imparten anualmente diversos Cursos de Postgrado a cargo de docentes/investigadores del DBBE.